電機帶動凸輪旋轉(zhuǎn)，當凸輪處于升程運動時，推動推桿向前運動；當凸輪處于回程時，由于彈簧的作用，推桿向后運動。由于柱塞裝在推桿機構上，因此柱塞隨著凸輪的旋轉(zhuǎn)在泵頭腔內(nèi)做直線運動。由于柱塞密封圈的作用，當柱塞向后運動時，泵頭腔內(nèi)形成負壓，輸出單向閥關閉，輸入單向閥打開，淋洗液通過輸入單向閥被吸入泵頭腔內(nèi)。當柱塞向前運動時，輸入單向閥關閉，輸出單向閥打開，淋洗液被推出泵頭腔內(nèi)，送入到分離柱系統(tǒng)中去。在單柱塞往復泵中凸輪一般均設計成偏心輪，偏心值按照電機的轉(zhuǎn)速和往復泵輸出的流量要求來確定。

　　單柱塞往復泵來回循環(huán)運動，前推時，淋洗液送入分離系統(tǒng)，由于是單柱塞運動，柱塞向回運動時，柱塞在淋洗液處于吸人溶液過程中暫停向分離系統(tǒng)輸送溶液，因此在整個運動過程中，淋洗液是脈沖式地送往分離系統(tǒng)，見流量輸出曲線圖。因此為了減緩脈沖現(xiàn)象，一般在輸出單向閥與色譜柱之間安裝脈沖阻尼器，脈沖阻尼器的功能是通過阻尼器的自身儲存容積和容積體的彈性作用減緩流量波動，起到緩沖作用，使流量輸出均勻。但脈沖阻尼器是靠容積和彈性來減緩脈沖的，因此增加了流路體積，為了減少譜帶展寬，便于清洗和更換淋洗液，阻尼器的體積應盡可能小。